长期从事 AI for Science领域，AI靶标发现与分子设计方向的研究工作。针对分子科学发现设计空间近乎无限、湿验证却昂贵缓慢且成功率极低的核心矛盾，研究“专家智慧+通用智能+专用工具+自动实验”四位一体协作的精准分子科学发现新范式，构建人机协同、干湿闭环的智能科研平台，推动AI从辅助计算走向落地实用的自主分子科学发现。相关工作已以主要作者身份发表于Nature Machine Intelligence、The Innovation、Advanced Science等期刊。目前研究兴趣包括:
- AI基础研究：大模型智能体与群体智能、图数据处理与图学习
- AI for Science研究：靶向小分子/肽/蛋白/小核酸/材料设计、干湿闭环机器科学家
交流ing：非常希望跟各位专家和同学建立联系，碰撞新思想和合作(微信yvquanli)
收稿ing：欢迎联系本人投稿至TIDD/The Innovation/Exploration/iMeta期刊，高质量稿件将推荐优先送审
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🎓 教育经历
| 2019.9 - 2024.6 | 博士 - 兰州大学，化学化工学院(专业：化学信息学，导师：姚小军教授) |
| 2015.9 - 2019.6 | 本科 - 青海大学，计算机学院(专业：计算机科学与技术) |
🧑💻 工作经历
| 2024.10 - 今 | 贵州大学 省大数据实验室/计算机科学与技术学院，特聘教授 |
| 2024.10 - 今 | 贵州大学 绿色农药全国重点实验室，流动研究人员 |
| 2024.10 - 今 | 中国-斯里兰卡茶叶绿色防控实验室，流动研究人员 |
| 2022.7 - 2023.4 | 北京智源人工智能研究院 付杰团队，研究实习 |
| 2020.8 - 2022.6 | 腾讯公司 量子实验室，联合培养(合作导师：谢昌谕博士) |
🏛️ 学术兼职
| 2026.5 - 今 | 中国生物信息学学会(筹)农林信息学专业委员会，青年委员 |
| 2026.1 - 今 | The Innovation Drug Discovery期刊(目标IF 25~30)，创刊筹委、学术编辑(执行) |
| 2025.8 - 今 | The Innovation期刊(综合一区 IF=39.5)，青年编委 |
| 2025.8 - 今 | iMeta期刊(生物一区 IF=44.4)，青年编委 |
| 2024.9 - 今 | Exploration期刊(综合一区 IF=30.4)，青年编委、青委会植物学部副主任 |
| 2026.1 | 第六届国际绿色植保技术创新会议，组委会 |
| 2025.1、2025.8 | 贵州省大数据局人工智能产业方向评审专家组，组长 |
📑 科研项目
[1]国家数据局数据集先行先试项目,全国作物病虫草-农药多模态植物保护数据集,2025,课题负责人
[2]贵州省实验室重大科研项目,能力化公共数据运营关键技术研究与应用,2026,课题负责人
[3]国家自然科学基金地区项目,基于人工智能的麦田蚜虫RNA干扰关键基因挖掘及广谱dsRNA设计,2026,主持
[4]贵州大学人才引进特岗项目,多约束小分子生成设计新方法研究,2024,主持
📝 学术论文
[1] Li et al. An adaptive graph learning method for automated molecular interactions and properties predictions. Nature Machine Intelligence IF=29.8
[HTML] [PDF]
[2] Li et al. Introducing block design in graph neural networks for molecular properties prediction. Chemical Engineering Journal IF=12.5
[HTML] [PDF]
[3] Li* et al. Spectral decomposition of chemical semantics for activity cliffs-aware molecular property prediction. Advanced Science IF=14.1
[HTML] [PDF]
[4] Li† et al. AI for science: Progress, challenges, and perspectives. The Innovation IF=39.5
[HTML] [PDF]
所有论文
2026年度
- [2026e] Shuo Liu, Xiang Zhang, Haixia Feng, Yuquan Li, Xiaoqing Gong, Yong Liang*, Xiaojun Yao*, Huanxiang Liu*. A unified hierarchical multiscale fusion framework for drug-target affinity prediction: from benchmark performance to nanomolar inhibitor discovery[J].
Advanced Science, 2026: e77345. [HTML] [PDF] - [2026d] Yongjun Xu†, Zezhi Shao†, Xin Liu†, Yuquan Li†, Zhulin An†, Chenguang Fu†, et al. AI for science: Progress, challenges, and perspectives[J].
The Innovation, 2026: 101530. [HTML] [PDF] - [2026c] Chaoyang Xie, Xiaorui Wang, Yawen Dong, Xiaojun Yao*, Gefei Hao*, Yuquan Li*. Reshaping the drug discovery ecosystem with open science and collaborative innovation[J].
The Innovation Drug Discovery, 2026, 1(1): 100016. [HTML] [PDF] - [2026b] Chaoyang Xie, Junhu Xu, Guangyi Huang, Shihang Wang, Mutian He, Xinyu Dong, Huiyang Hong, Xiaojun Yao, Qi Wang*, Yuquan Li*. Spectral decomposition of chemical semantics for activity cliffs-aware molecular property prediction[J].
Advanced Science, 2026: e17579. [HTML] [PDF] - [2026a] Huiyang Hong, Xinkai Wu, Hongyu Sun, Chaoyang Xie, Qi Wang*, Yuquan Li*. Learning hierarchical interaction for accurate molecular property prediction[J].
Communications Chemistry,2026. [HTML] [PDF]
2025年度
- [2025c] Yanan Tian, Ruiqiang Lu, Xiaoqing Gong, Yuquan Li, Wei Zhao, Xiaorui, Wang, Xinming Jia, Qin Li, Yuwei Yang, Henry H. Y. Tong, Joel P. Arrais*, Huanxiang Liu*, Xiaojun Yao*. Enhancing Kinase-Inhibitor Activity and Selectivity Prediction Through Multimodal and Multiscale Contrastive Learning with Attention Consistency[J].
Nature Communications,2025,16:10860. [HTML] [PDF] - [2025b] Xiaorui Wang†, Xiaodan Yin†, Xujun Zhang†, Huifeng Zhao, Shukai Gu, Zhenxing Wu, Odin Zhang, Wenjia Qian, Yuansheng Huang, Yuquan Li, Dejun Jiang, Mingyang Wang, Huanxiang Liu, Xiaojun Yao*, Chang-Yu Hsieh*, Tingjun Hou*. A virtual platform for automated hybrid organic-enzymatic synthesis planning[J].
Nature Communications,2025,16:10929. [HTML] [PDF] - [2025a] Zhenglu Chen, Chunbin Gu*, Shuoyan Tan, Xiaorui Wang, Yuquan Li, Mutian He, Ruiqiang Lu, Shijia Sun, Chang-Yu Hsieh*, Xiaojun Yao*, Huanxiang Liu*, Pheng-Ann Heng. Interpretable PROTAC Degradation Prediction With Structure-Informed Deep Ternary Attention Framework[J].
Advanced Science, 2025. [HTML] [PDF]
2024年度
- [2024a] Xiaorui Wang, Xiaodan Yin, Dejun Jiang, Huifeng Zhao, Zhenxing Wu, Odin Zhang, Jike Wang, Yuquan Li, Yafeng Deng, Huanxiang Liu, Pei Luo, Yuqiang Han, Tingjun Hou*, Xiaojun Yao*, Chang-Yu Hsieh*. Multi-modal deep learning enables efficient and accurate annotation of enzymatic active sites[J].
Nature Communications, 2024, 15(1): 7348. [HTML] [PDF]
2023年度
- [2023a] Xiaorui Wang†, Chang-Yu Hsieh†, Xiaodan Yin, Jike Wang, Yuquan Li, Yafeng Deng, Dejun Jiang, Zhenxing Wu, Hongyan Du, Hongming Chen, Yun Li, Huanxiang Liu, Yuwei Wang, Pei Luo, Tingjun Hou*, Xiaojun Yao*. Generic Interpretable Reaction Condition Predictions with Open Reaction Condition Datasets and Unsupervised Learning of Reaction Center[J].
Research, 2023, 6: 0231. [HTML] [PDF]
2022年度
- [2022a] Yuquan Li†, Chang-Yu Hsieh†, Ruiqiang Lu, Xiaoqing Gong, Xiaorui Wang, Pengyong Li, Shuo Liu, Yanan Tian, Dejun Jiang, Jiaxian Yan, Qifeng Bai, Huanxiang Liu, Shengyu Zhang , Xiaojun Yao*. An adaptive graph learning method for automated molecular interactions and properties predictions[J].
Nature Machine Intelligence, 2022, 4(7):645-651. [HTML] [PDF]
2021年度
- [2021c] Pengyong Li†, Yuquan Li†, Chang-Yu Hsieh, Shengyu Zhang, Xianggen Liu, Huanxiang Liu, Sen Song*, Xiaojun Yao*. TrimNet: learning molecular representation from triplet messages for biomedicine[J].
Briefings in Bioinformatics, 2021, 22(4): bbaa266.[HTML] [PDF] - [2021b] Xiaorui Wang†, Yuquan Li†, Jiezhong Qiu, Guangyong Chen, Huanxiang Liu, Benben Liao*, Chang-Yu Hsieh*, Xiaojun Yao*. RetroPrime: A Diverse, plausible and Transformer-based method for Single-Step retrosynthesis predictions[J].
Chemical Engineering Journal, 2021, 420: 129845. [HTML] [PDF] - [2021a] Yuquan Li, Pengyong Li, Xing Yang, Chang-Yu Hsieh, Shengyu Zhang, Xiaorui Wang, Ruiqiang Lu, Huanxiang Liu, Xiaojun Yao*. Introducing block design in graph neural networks for molecular properties prediction[J].
Chemical Engineering Journal, 2021, 414: 128817. [HTML] [PDF]
*通讯 †共一
👥 团队成员
|
名下指导 蒋俞萱,25硕,RNA小分子抑制剂 陈维迅,25硕,智能体分子设计 |
联培博士 董新宇¹,24博,多目标分子生成 黄广义¹,24博,AI靶标发现 何牧天²,25博,大分子药物 王世航²,25博,细胞表型学习 龚道宏²,25博,靶向蛋白降解设计 崔金煜³,25博,多肽及递送设计 唐胡双寅²,26博,递送系统 |
联培硕士 周军¹, 24硕,合成规划 朱磊³, 24硕,抗菌肽设计 谢朝阳⁴,23硕,分子性质预测 毕业成员 洪晖阳, 22本,已前往侯廷军教授组 |
深度合作导师：郝格非¹、姚小军²、杨文超³、联培导师⁴
深度合作伙伴：王晓瑞，深圳理工大学合成生物学院，特聘副教授，研究方向为AI合成规划
🌟 奖项荣誉
| 2026.10 | The Innovation Drug Discovery 期刊 Excellent Youth Editor Award |
| 2025.9 | Exploration期刊 2025年度杰出青年编委奖 |
| 2024.10 | 贵州大学一流学科建设特别引进人才 |
📜 专利软著
[1]基于人工智能的化学反应设计方法、系统及计算机设备,ZL 2026 1 0390758.3,授权公告号CN 122290745 B,2026.09.15授权,专利权人贵州大学,第一发明人
🏛️ 学术活动
| 2026.9 | 作为专家参与贵州省委金融办数字金融方向讨论会议 |
| 2026.8 - 今 | 《植物保护》期刊，首届青年编委 |
| 2026.8 | 参加2026科学智能大会（AI for Science Congress 2026，北京），学术墙报 |
| 2026.8 | 作为专家参与贵州省科学技术厅人工智能方面会议咨询3次 |
| 2026.7 | 作为专家参与贵州省大数据局大数据方面讨论会议 |
| 2026.5 | 聘为全国研究生教育评估监测专家库专家，进行硕士、博士学位论文评审 |
| 2026.5 | The Innovation Drug Discovery 青年编委会 |
| 2026.3 | The Innovation期刊青年编委会 |
| 2026.1 | Exploration首届植物科学国际研讨会，负责人 |
| 2026.1 | 第六届国际绿色植保技术创新会议，报告题目：AI驱动的必须基因挖掘与RNAi农药设计 |
| 2025.11 | 扬州大学，保绿兴农学术大讲堂，报告题目：人工智能辅助农药设计 |
| 2025.11 | "全国作物病虫草-农药多模态智慧植保高质量数据集"入选《中国农业农村年鉴》2025卷"科教兴农"专版(农业农村部主管) |
| 2025.10 | 第十四届全国生物信息学与系统生物学学术大会，报告题目：多目标梯度引导分子生成 |
| 2025.10 | 第三届全国博士后创新创业大赛揭榜领题赛，"智创新药，稻麦无忧"，银奖 |
| 2025.8 | 中国植物保护学会青托论坛，会务秘书 |
| 2025.6 | 第十六届蓝桥杯全国软件和信息技术专业人才大赛，第一指导教师，国家级三等奖2项、优秀奖1项 |
| 2024.9 - 今 | Medicine Bulletin期刊，青年编委 |
| 2024.9 - 今 | AI for Science期刊，青年编委 |
| 2024.9 - 今 | 药学学报期刊，青年编委 |
| 2024.8 - 今 | 中斯茶叶绿色防控一带一路国际联合实验室，创始建设参与 |
| 2023.3 | 兰州大学第十五届研究生学术年会，报告题目：化学×AI，现在与未来 |
| 会员 | 中国植保学会、中国人工智能学会、中国计算机学会、中国化学会等 |
| 审稿 | iMeta、Nature Communications、Advanced Science、Briefings in Bioinformatics、JCIM等 |
| 期刊 | 作为学术编辑(执行)，完成The Innovation Drug Discovery期刊相关工作(青年编委面试组组长3次，全权稿件处理5次)；作为青年编委，完成iMeta期刊相关工作(生物信息学专刊组织) |
| 其他 | Exploration期刊青委会西南分区主任 |
🙌 其他
大乱斗，War3 RPG/RTS，DNF
传世烧火棍*5 拥有者
我清楚的知道，人与人之间的道路是不可复制的，我躺在我自己的床上。
世界一流底刊《Silence》 期刊副主编(Associate Editor, AE)
世界一流底刊《Call》 期刊副主编(Associate Editor, AE)
